Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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