Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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