Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprqP0C5E4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms