Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BlmO88700 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BlmO88700 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BlmO88700 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms