Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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