Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Col5a1O88207 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Col5a1O88207 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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