Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms