Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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