Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms