Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms