Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrt1O35449 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrt1O35449 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms