Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms