Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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