Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MttpO08601 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
MttpO08601 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MttpO08601 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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MttpO08601 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MttpO08601 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms