Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ascl4M0QW46 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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