Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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