Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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