Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmgcF6VRN1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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