Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8247F6VRJ8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms