Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad2bE9Q166 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms