Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms