Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms