Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Samd1D3YXK1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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