Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig10D3YX43 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig10D3YX43 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms