Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms