Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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