Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apba1B2RUJ5 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms