Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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