Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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