Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms