Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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