Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms