Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm2A2A7B5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms