Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf346Q9R0B7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms