Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms