Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf4Q9QZS2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf4Q9QZS2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf4Q9QZS2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf4Q9QZS2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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