Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms