Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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