Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms