Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Mrpl39Q9JKF7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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