Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms