Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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