Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Rb1cc1Q9ESK9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Rb1cc1Q9ESK9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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Rb1cc1Q9ESK9 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Rb1cc1Q9ESK9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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