Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms