Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms