Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms