Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms