Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms