Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifi35Q9D8C4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifi35Q9D8C4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms