Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Capns2Q9D7J7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms